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本系以「強調生物技術教育的醫學檢驗學系」為課程規劃理念,設計智能與人文兼容並包之通識及共同課程、基礎醫學課程、醫學檢驗課程、生物技術課程、創新實作課程、職場接軌課程等六大重點,以達到培育醫學檢驗技能與臨床實驗室管理之專業人才、培育生物醫學與生物科技之研究興趣、與培養學生從事醫學檢驗及生技產業之志向之教育目標。自97學年度起並提供修讀輔系與學程之課程管道,增加學生修習第二專長;並規劃學生一貫修讀學、碩士學位課程,協助優秀的學生以五年的時間同時取得本系所學士與碩士學位。